علاوه بر وجود دستگاه‌های اتوماتیک، آزمایش‌های غیر وابسته به دستگاه شمارنده سلولی نیز بر اساس روش‌های تایید شده از طرف آزمایشگاه مرجع سلامت کشور انجام می‌شود که می‌توان به موارد ذیل اشاره کرد:

• الکتروفورز هموگلوبین جهت ردیابی علت کم‌خونی‌های غیر از فقر آهن، کم‌خونی‌های بدون علت، الکتروفورز پروتئین‌های خون با علل شایع در تشخیص ناهنجاری‌های کبد و مغز استخوان 
• آزمایش G6PD برای تشخیص علت زردی در نوزادانی که کاهش بیلی‌‌روبین خون در آن‌ها به طول انجامیده یا زردی و کم‌خونی بدون علت در نوزادان، اطفال و حتی بزرگسالان
• سایر آزمایش‌هایی که تشخیص آنها وابسته به تهیه لام خون محیطی است 

• دستگاه شمارنده سلولی Sysmex XS800i: این سل کانتر ساخت کشور ژاپن بوده و سلول‌ها را با روش فلوسایتومتری به صورت سه‌بعدی و منحصر از سایر روش‌های شمارش در سایر دستگاه‌های موجود در کشور شناسایی و شمارش می‌کند. این دستگاه قابلیت تشخیص حتی یک سلول غیرنرمال و یا مشکوک در خون انسان را دارا می‌باشد؛ به همین دلیل به دستگاه شمارنده فول‌دیف (Full DIFF) معروف است و برای پزشکان از اهمیت تشخیصی بالایی برخوردار است.

• شمارنده سلولی Sysmex KXn21: از این دستگاه به عنوان دستگاه پشتیبان استفاده می‌شود تا نتایج با دو دستگاه مدام تحت کنترل، آنالیز و مقایسه قرار گیرد.

• برای انجام آزمایش ESR از دستگاه صد کاناله Lena استفاده می‌شود که ظرف مدت بیست دقیقه، بعد از قرار دادن نمونه در دستگاه جواب زمایش را خوانش می‌کند.

• Sysmex 50 A: دستگاه اکوآکلومتر 4 کاناله ساخت شرکت Symsmex ژاپن جهت انجام تست PTT,PT,Fibrinogen است.

• Coa Data 501: دستگاه تک کاناله اکوآکوامتر ساخت کمپانی iTEC کشور آلمان برای انجام تست های PT, PTT, TT, FIB, factor assays و ...

در بخش هماتولوژی نیز براساس الزامات آزمایشگاه مرجع سلامت و سایر استانداردهای بین‌المللی آزمایشگاهی برنامه‌های جامع کنترل کیفی تدوین شده که به صورت روزانه، هفتگی و ماهیانه توسط مسئول واحد هماتولوژی و مسئول کنترل کیفی اجرا و نظارت می‌شود.