در بخش تخصصی آلرژی با استفاده از نمونه ی خون، بررسی 40 نوع آلرژن تنفسی و غذایی صورت می گیرد. مزیت این نوع از تست آلرژی بی خطر بودن آن نسبت به تست های پوستی می باشد. جهت انجام این تست از کیت های یوروایمیون ساخت کشور آلمان بهره گرفته می شود. 

مانند سایر بخش‌ها، در این بخش نیز برنامه‌های کنترل کیفی در نظر گرفته شده است که توسط مسئول مربوطه در بخش، سوپروایزر و مسئول فنی کنترل می‌گردد.